Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc96Q9CR92 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc96Q9CR92 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms