Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACSIN1Q9BY11 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PACSIN1Q9BY11 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms