Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS2Q9BXC9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms