Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP85Q9BW27 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms