Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx30Q99PU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx30Q99PU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx30Q99PU8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx30Q99PU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx30Q99PU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx30Q99PU8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dhx30Q99PU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dhx30Q99PU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx30Q99PU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms