Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp4Q99ME9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms