Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gps1Q99LD4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms