Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms