Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TOPBP1Q92547 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOPBP1Q92547 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOPBP1Q92547 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms