Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spdl1Q923A2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spdl1Q923A2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms