Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Supt16hQ920B9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt16hQ920B9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms