Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cep57l1Q8VDS7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep57l1Q8VDS7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep57l1Q8VDS7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms