Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam20bQ8VCS3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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