Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms