Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms