Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atad2Q8CDM1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atad2Q8CDM1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms