Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms