Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms