Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ssxb10Q6XAR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Ssxb10Q6XAR7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssxb10Q6XAR7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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