Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms