Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx11Q6AXC6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms