Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rftn1Q6A0D4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms