Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
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Clcn1Q64347 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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Clcn1Q64347 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
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Clcn1Q64347 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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Clcn1Q64347 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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Clcn1Q64347 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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Clcn1Q64347 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn1Q64347 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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Clcn1Q64347 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Clcn1Q64347 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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