Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic3Q62521 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms