Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms