Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mkrn3Q60764 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms