Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a1Q60714 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms