Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38BQ5VTL8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38BQ5VTL8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms