Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme4Q5SSW2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms