Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim7Q5RKS2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim7Q5RKS2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms