Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C87499Q3UX49 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms