Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm10Q3UTQ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm10Q3UTQ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms