Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SfswapQ3USH5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfswapQ3USH5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms