Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE31

Uncharacterized protein KIAA0930 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UE31 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UE31 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UE31 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UE31 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UE31 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UE31 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UE31 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UE31 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UE31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UE31 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UE31 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3UE31 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3UE31 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3UE31 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3UE31 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3UE31 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3UE31 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3UE31 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3UE31 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3UE31 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3UE31 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3UE31 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3UE31 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UE31 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UE31 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UE31 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UE31 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UE31 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UE31 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UE31 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UE31 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UE31 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UE31 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UE31 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UE31 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UE31 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UE31 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UE31 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UE31 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UE31 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UE31 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UE31 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UE31 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms