Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNA1Q09470 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms