Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate4Q09098 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms