Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah2Q06986 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms