Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Caprin2Q05A80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Caprin2Q05A80 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms