Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yy1Q00899 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yy1Q00899 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yy1Q00899 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms