Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Xrn1P97789 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Xrn1P97789 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrn1P97789 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms