Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme1P97371 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme1P97371 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme1P97371 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme1P97371 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psme1P97371 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme1P97371 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Psme1P97371 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms