Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP4F2P78329 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F2P78329 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms