Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms