Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms