Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Psen1P49769 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psen1P49769 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms