Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCR3P49682 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms