Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd4P46935 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nedd4P46935 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nedd4P46935 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms