Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kdm5cP41230 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5cP41230 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms