Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms