Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acvr1P37172 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acvr1P37172 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms